一种基因表达量的检测数据管理方法及装置与流程

    专利2025-12-22  7


    本说明书涉及生物细胞数据分析领域,尤其涉及一种基因表达量的检测数据管理方法及装置。


    背景技术:

    1、基于机器学习等依托于大数据的生物细胞数据分析技术广泛应用于科研和工程领域。

    2、目前,为了训练生物细胞数据分析相关的机器模型,往往需要获取大量的存储基因表达量检测值的源文件,并从每个源文件中筛选出所需的基因表达量检测值,作为训练集或测试集,用以训练该机器模型。但是不同的检测数据源文件,所用的存储方式也不同,因此需要逐一从各检测数据源文件按照筛选标准筛选基因表达量检测值。而这种逐一筛选的方式筛选效率低。

    3、基于此,本说明书提供了一种基因表达量的检测数据管理方法及装置。


    技术实现思路

    1、本说明书提供一种基因表达量的检测数据管理方法及装置,以部分的解决现有技术存在的上述问题。

    2、本说明书采用下述技术方案:

    3、本说明书提供了一种基因表达量的检测数据管理方法,所述方法包括:

    4、响应于用户的管理请求,获取所述管理请求携带的存储基因表达量检测值的源文件;

    5、从所述源文件中提取各基因表达量检测值的第一标签信息,其中,所述基因表达量检测值和所述第一标签信息为一一对应关系;

    6、针对每个第一标签信息,从预设的第一数据仓库中检索该第一标签信息,并根据检索结果,确定该第一标签信息的有效性;

    7、若该第一标签信息的有效性为有效,则将该第一标签信息以及该第一标签信息的基因表达量检测值,作为检测数据,并按照预设规则,将该检测数据存入预设的第二数据仓库;

    8、根据所述第二数据仓库中的各检测数据,确定管理信息,所述管理信息用于返回给所述用户。

    9、可选地,在针对每个第一标签信息,从预设的第一数据仓库中检索该第一标签信息,并根据检索结果,确定该第一标签信息的有效性之前,所述方法还包括:

    10、响应于用户的标签管理请求,获取所述标签管理请求携带的第二标签信息,并根据所述第二标签信息,更新预设的第一数据仓库。

    11、可选地,所述第一标签信息包括基因标签和性状标签;

    12、从预设的第一数据仓库中检索该第一标签信息,并根据检索结果,确定该第一标签信息的有效性,具体包括:

    13、在预设的第一数据仓库中检索该第一标签信息的基因标签是否存在;

    14、若是,则确定该基因标签对应的各性状标签,作为检索结果,并将该第一标签信息的性状标签与所述检索结果进行匹配,并根据匹配结果,确定该第一标签信息的有效性;

    15、若否,则确定该第一标签信息的有效性为非有效。

    16、可选地,将该第一标签信息的性状标签与所述检索结果进行匹配,并根据匹配结果,确定该第一标签信息的有效性,具体包括:

    17、判断该第一标签信息的性状标签与所述检索结果是否匹配;

    18、若是,则确定该第一标签信息的有效性为有效;

    19、若否,则确定该第一标签信息的有效性为非有效。

    20、可选地,所述方法还包括:

    21、若该第一标签信息的有效性为非有效,则将该第一标签信息以及该第一标签信息的基因表达量检测值,作为检测数据,并按照所述预设规则,将该检测数据存入预设的第三数据仓库。

    22、可选地,所述方法还包括:

    23、确定所述第一数据仓库中当前存储的各筛选标签信息;

    24、针对每个筛选标签信息,从所述第三数据仓库中确定与该筛选标签信息一致的第一标签信息,并将该第一标签信息所属的检测数据移入所述第二数据仓库中。

    25、可选地,在按照预设规则,将该检测数据存入预设的第二数据仓库之后,所述方法还包括:

    26、将所述第二数据仓库中的各检测数据,作为训练数据,所述训练数据用于训练机器模型。

    27、本说明书提供了一种基因表达量的检测数据管理系统,所述系统包括标签管理单元、源文件处理单元以及信息管理单元;其中:

    28、所述标签管理单元响应于用户的标签管理请求,获取所述标签管理请求携带的第二标签信息,并根据所述第二标签信息,更新预设的第一数据仓库;接收所述源文件处理单元发送的第一标签信息后,针对每个第一标签信息,从预设的第一数据仓库中检索该第一标签信息,并根据检索结果,确定该第一标签信息的有效性;将各第一标签信息的有效性返回给所述源文件处理单元;

    29、所述源文件处理单元响应于用户的管理请求,获取所述管理请求携带的存储基因表达量检测值的源文件;从所述源文件中提取各基因表达量检测值的第一标签信息,其中,所述基因表达量检测值和所述第一标签信息为一一对应关系;将所述第一标签信息发送给所述标签管理单元;接收所述标签管理单元返回的各第一标签信息的有效性,并针对每个第一标签信息,若该第一标签信息的有效性为有效,则将该第一标签信息以及该第一标签信息的基因表达量检测值,作为检测数据,并按照预设规则,将该检测数据存入预设的第二数据仓库;

    30、所述信息管理单元根据所述第二数据仓库中的各检测数据,确定管理信息,所述管理信息用于返回给所述用户。

    31、本说明书提供了一种计算机可读存储介质,所述存储介质存储有计算机程序,所述计算机程序被处理器执行时实现一种基因表达量的检测数据管理方法。

    32、本说明书提供了一种电子设备,所述电子设备包括存储器、处理器及存储在存储器上并可在处理器上运行的计算机程序,所述处理器执行所述程序时实现一种基因表达量的检测数据管理方法。

    33、本说明书采用的上述至少一个技术方案能够达到以下有益效果:在本说明书提供的一种基因表达量的检测数据管理方法,响应于用户的管理请求,获取该管理请求携带的存储基因表达量检测值的源文件,并从源文件中提取各基因表达量检测值的第一标签信息,以及针对每个第一标签信息,从第一数据仓库中检索该第一标签信息,确定该第一标签信息的有效性,当有效性为有效时,将该第一标签信息以及该第一标签信息的基因表达量检测值,作为检测数据,按照预设规则存入预设的第二数据仓库,根据该第二数据仓库中的各检测数据,确定管理信息,并将该管理信息用于返回给用户。

    34、从上述方法可以看出,在第一数据仓库中检索并确定各第一标签信息的有效性,将第一标签信息的有效性为有效作为筛选标准,确定符合该筛选标准的检测数据,实现了对源文件中基因表达量检测值的筛选,以及将检测数据通过预设规则存入第二数据仓库,实现了基因表达量检测值存储方式的统一,便于用户后续管理。



    技术特征:

    1.一种基因表达量的检测数据管理方法,其特征在于,包括:

    2.如权利要求1所述方法,其特征在于,在针对每个第一标签信息,从预设的第一数据仓库中检索该第一标签信息,并根据检索结果,确定该第一标签信息的有效性之前,所述方法还包括:

    3.如权利要求1所述方法,其特征在于,所述第一标签信息包括基因标签和性状标签;

    4.如权利要求3所述方法,其特征在于,将该第一标签信息的性状标签与所述检索结果进行匹配,并根据匹配结果,确定该第一标签信息的有效性,具体包括:

    5.如权利要求1所述方法,其特征在于,所述方法还包括:

    6.如权利要求5所述方法,其特征在于,所述方法还包括:

    7.如权利要求1所述方法,其特征在于,在按照预设规则,将该检测数据存入预设的第二数据仓库之后,所述方法还包括:

    8.一种基因表达量的检测数据管理系统,其特征在于,所述系统包括标签管理单元、源文件处理单元以及信息管理单元;其中:

    9.一种计算机可读存储介质,其特征在于,所述存储介质存储有计算机程序,所述计算机程序被处理器执行时实现上述权利要求1~7任一项所述的方法。

    10.一种电子设备,其特征在于,包括存储器、处理器及存储在存储器上并可在处理器上运行的计算机程序,其特征在于,所述处理器执行所述程序时实现上述权利要求1~7任一项所述的方法。


    技术总结
    在本说明书提供的一种基因表达量的检测数据管理方法及装置中,响应于用户的管理请求,通过提取该管理请求携带的存储基因表达量检测值的源文件中的各第一标签信息,以及针对每个第一标签信息,从第一数据仓库中检索该第一标签信息,确定有效性,当有效性为有效时,将该第一标签信息以及该第一标签信息的基因表达量检测值,作为检测数据,并按照预设规则,存入第二数据仓库,通过该第二数据仓库中的检测数据,确定管理信息返回给用户。将第一标签信息的有效性为有效作为筛选标准,确定符合该筛选标准的检测数据,并按照预设规则存入第二数据仓库,实现了对源文件中基因表达量检测值的筛选,以及实现了存储方式的统一,便于用户后续管理。

    技术研发人员:张秋云,许吾琴,郑进芳,刘扶芮,杨耀
    受保护的技术使用者:之江实验室
    技术研发日:
    技术公布日:2024/4/29
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