本发明申请属于甜瓜育种，具体涉及一种基于甜瓜叶片黄化特征snp位点的分子标记及其应用。
背景技术：
1、甜瓜(cucumis melo l.)属葫芦科甜瓜属的甜瓜种，一年生攀援性草本植物，是世界主要水果之一。甜瓜制种产业中关键一点是种子的纯度鉴定工作，但现有种子纯度检验技术大多数为加代种植，通过后代表现性状鉴定种子纯度，此种方法存在费时、费工的缺点，因此急需有一项更加方便快捷的种子纯度鉴定技术。甜瓜叶色突变体能够很好地解决这一问题，通过利用甜瓜叶色黄化突变体为母本、正常叶色甜瓜材料为父本进行杂交育种，则其后代种子纯度在苗期即可鉴定。因此，对黄叶甜瓜材料加以改良利用，培育性状优良的黄叶甜瓜品系，能够缩短制种流程，降低制种成本。
2、而在甜瓜叶色突变基因的研究上，国内已有报道，郑婧等通过对薄皮甜瓜自然黄化突变体材料‘1521’的研究表明黄化性状由一对隐性基因控制。朱华玉等通过对对厚皮甜瓜黄绿叶色材料m68的研究初步把ygl基因定位在甜瓜第11染色体上。王晓娟初步解析了黄绿叶色材料m68控制甜瓜黄绿叶色性状的基因cmglk调节甜瓜叶绿体发育的遗传调控网络和分子机理。然而由于育种需求的不同，当前需要获得更多的具有良好生长优势叶片黄化材料及开发对应的鉴定分子标记。
技术实现思路
1、发明人基于对黄化突变材料c40的研究发现，其黄化性状突变发生在甜瓜第8号染色体melo3c007233上，在1609229 bp处发生一个a→g的突变，此突变会引起甜瓜的叶片颜色由绿色转变为黄色，基于此研究开发了鉴定该甜瓜黄化突变的dcaps分子标记c-43，根据此标记设计的引物扩增后酶切可以快速准确鉴定出甜瓜品种或品系是否携带该黄化突变基因及其同源基因，也可以快速鉴定该类甜瓜新品种的种子纯度。
2、本申请的第一个方面提供了一种用于检测甜瓜叶片黄化特征的snp标记，所述snp标记为甜瓜基因组第8号染色体melo3c007233上，第1609229 位核苷酸由a突变为g。
3、本发明的第二个方面提供了一种用检测甜瓜叶片黄化特征的dcaps标记，其引物序列如下所示：
4、上游引物：5’- catttccatttcccatcct -3’，
5、下游引物：5’- ctcctcgacaatcttcactct -3’。
6、进一步的，所述snp位点的dcaps分子标记的限制性内切酶，所述引物酶切反应所用限制性内切酶为rsai。
7、本发明的第三个方面，提供了一种dcaps标记鉴定甜瓜叶片黄化特征的方法：提取甜瓜叶片全基因组dna；
8、利用所述dcaps标记的引物对西瓜基因组dna进行pcr扩增；
9、酶切pcr扩增产物；
10、电泳酶切产物，根据酶切产物的带型判断甜瓜叶片黄化特征的表型，甜瓜叶片黄化特征显示154 bp的带型，其它叶片特征显示134 bp的带型或者154 bp和134 bp两条带。
11、本申请实施例中提供的一个或多个技术方案，至少具有如下技术效果或优点：
12、本申请基于所发现的snp位点所设计的dcaps标记具有快速、直接、特异性高等特点，可在较短时间内完成大批量甜瓜叶片黄化特征材料的筛选好预测工作，可有效服务于涉及甜瓜叶片黄化特征的甜瓜育种及种子纯度鉴定。
1.一种甜瓜叶片黄化特征snp标记，其特征在于，其为甜瓜基因组第8号染色体melo3c007233上，第 1609229 位核苷酸由叶片非黄化特征的a突变为叶片黄化特征的g。
2.一种用于检测甜瓜叶片黄化特征的dcaps标记，其特征在于，基于对应的snp位点设计如下引物：
3.依据权利要求2所述的dcaps标记，其特征在于，与所述引物匹配使用的限制性内切酶为rsai。
4.一种鉴定甜瓜叶片黄化特征的方法，其特征在于，包括以下步骤：
5.一种试剂盒，包括权利要求2中所述引物、限制性内切酶rsai。
6.权利要求1所述甜瓜叶片黄化特征snp标记、权利要求2所述dcaps分子标记或权利要求5所述试剂盒在鉴定和/或辅助筛选甜瓜叶片黄化特征育种中的应用。
7.权利要求1所述甜瓜叶片黄化特征snp标记、权利要求2所述dcaps分子标记或权利要求5所述试剂盒在甜瓜种子纯度鉴定中的应用。
