本发明属于水产养殖品种的遗传育种,具体涉及一种缢蛏的生长性状相关的分子标记及其在育种中的应用。
背景技术:
1、缢蛏(sinonovaculaconstricta)俗称蛏子,属于双壳纲(bivalvia)、帘蛤目(veneroida)、竹蛏科(solenidae)、缢蛏属(sinonovacula),广泛分布于中国、日本和朝鲜等国的沿海地区,埋栖生活,生长快,味道鲜美,营养丰富,具有较高的经济价值,是中国四大海产贝类之一。我国在20世纪90年代初开展了缢蛏的人工育苗并且取得成功,目前养殖单位主要采用人工苗进行养殖生产,且用于繁殖人工苗的亲贝多来自池塘人工养殖,随着多年的人工养殖与频繁近交导致缢蛏物种多样性下降,种质退化,近年来,一龄养殖缢蛏个体普遍较小,二龄蛏养殖成本过高,养殖效益差,市场上仍未有人工选育的缢蛏良种。随着缢蛏的人工繁育技术日趋成熟,养殖产业正在逐步形成,对生长快,养殖周期短的缢蛏品种的需求度越来越高,因此,研究与缢蛏生长发育机制相关的基因,认识其生长调控的分子机制,对缢蛏的良种选育、提高其养殖性能和推动养殖业的发展具有重要意义。
2、长期以来,贝类的养殖工作一直以表型为基础,但是其表型受到环境因素的影响很大。根据表型对性状的选择,其效率较低。因此,利用分子辅助育种的方法能更有效改善其养殖进程,这对缢蛏养殖尤为重要。
技术实现思路
1、本发明的目的是提供一种缢蛏的生长性状相关的分子标记及其在育种中的应用,通过分析育苗养殖场内养殖的种群生长性状的差异,来筛选与生长性状相连锁的分子标记,并使用筛选的分子标记来筛选亲本用于缢蛏的遗传育种。
2、本发明首先提供一种与缢蛏生长性状相关的微卫星位点,其核苷酸序列为seq idno:1;
3、本发明提供的微卫星位点用于选育具有快速生长潜力的缢蛏个体。
4、本发明另一个方面提供一种筛选具有快速生长潜力的缢蛏个体的方法,是通过检测上述的微卫星位点来实现的;
5、所述的方法,是通过pcr扩增待检测的缢蛏个体的核酸样品,pcr产物进行基因测序分析后确定待检测的个体的基因型,来确定是否具有快速生长潜力;
6、所述的pcr扩增方法,其中所使用的引物的序列信息如下:
7、f:5’-taagggttttgaaattgtgtg-3’(seq id no:2)、
8、r:5’-gctcatttagagcttatggtg-3’(seq id no:3)
9、所述的pcr与基因测序分析,是确定微卫星位点的基因型分型,其中基因型为153/157个体的壳长、壳宽和总重的均值显著高于其他基因型个体生长性状的表型值(p<0.05)。
10、本发明通过对不同生长性状的缢蛏品种的扩增产物进行分析,获得了与缢蛏生长性状相连锁的微卫星标记,使用该微卫星标记可以筛选具有更好生长潜力的缢蛏个体,从而为缢蛏的遗传育种操作提供有效的分子标记。
1.一种微卫星位点,其特征在于,所述的微卫星位点的核苷酸序列为seq id no:1。
2.权利要求1所述的微卫星位点在选育具有快速生长潜力的缢蛏亲本中的应用。
3.一种筛选具有快速生长潜力的缢蛏个体的方法,其特征在于,所述的额方法是通过检测权利要求1所述的微卫星位点的基因型来进行筛选的。
4.如权利要求3所述的方法,其特征在于,所述的方法是通过引物对扩增待检测的缢蛏个体的核酸样品,pcr产物进行基因测序分析后确定待检测的个体的基因型,来确定是否具有快速生长潜力。
5.如权利要求4所述的方法,其特征在于,所述的引物对,其上游引物的序列为seq idno:2,下游引物的序列为seq id no:3。
6.如权利要求4所述的方法,其特征在于,所述的方法是筛选基因型为153/157。