本申请涉及玉米snp位点筛选，具体涉及玉米snp位点的筛选方法、装置、电子设备及介质。
背景技术：
1、玉米作为我国重要粮食作物之一，不断通过现代作物育种技术提高其增产潜力。而育种改良需依赖于重要农艺性状关键基因的挖掘和基因型的分析，这些性状通常是由多个数量性状位点控制，加大了对数量性状多位点基因型选择的困难程度。snp(单核苷酸多态性)作为第三代分子标记，在玉米育种和基因组的研究中已经有了较为成熟的应用，可以用来进行基因定位、绘制遗传图谱以及分子辅助育种等。
2、为了快速检测snp位点，1991年fodor等提出基因芯片概念，该技术迅速发展并得到了广泛研究。目前使用最多的snp检测芯片主要来自illumina公司、affymetrix公司以及agilent公司，实现了快速、高效、高通量、并行的多态信息分析。
3、在玉米遗传育种中，随着玉米全基因组测序的发展，鉴定玉米标记基因型的技术不断出现，但仍存在着成本较高以及耗费时间较长等问题。快速筛选出适合于玉米品种的鉴定、目标性状的连锁和关联分析的snp位点，不仅适合于对玉米重要农艺性状表型进行预测及鉴定，并且还适合于制备snp位点芯片，例如将适合于检测这些筛选snp位点的引物和/或探针或其他可检测物固定在芯片材料表面，以为玉米种质资源鉴定、玉米亲缘分析、玉米聚类分析、鉴别或鉴定玉米品种、玉米分子育种、构建玉米dna指纹数据库、检测玉米品种真实性、玉米种质资源遗传分析、玉米农艺性状的预测、玉米基因定位及克隆、玉米功能基因鉴定、玉米基因分型等提供帮助。
技术实现思路
1、基于此，本申请实施例至少公开了玉米snp位点的筛选方法、装置、电子设备及介质。
2、第一方面，实施例公开了玉米snp位点的筛选方法。该筛选方法包括：获取第一材料集的候选snp位点数据和第二材料集的表型数据；整理所述候选snp位点数据；以及对整理的所述候选snp位点数据与所述表型数据进行关联分析，得到与所述表型数据相关度最高的snp位点。其中，所述snp位点数据的整理步骤包括：识别所述候选snp位点数据中与snp位点关联的第一字符串；响应于所述第一字符串转换生成第二字符。所述第一字符串用于标识所述候选snp位点数据中的snp所在位点的变异的单核苷酸碱基信息以及参考基因组的单核苷酸碱基信息。所述第二字符表征所述snp位点对应的基因型。
3、第二方面，实施例公开了一种玉米snp位点的筛选装置。该筛选装置包括：数据获取单元，用于获取第一材料集的候选snp位点数据和第二材料集的表型数据；数据整理单元，用于整理所述候选snp位点数据；以及数据分析单元，用于对整理的所述候选snp位点数据与所述表型数据进行关联分析，得到与所述表型数据相关度最高的snp位点。其中，所述数据整理单元还包括：识别模块，用于识别所述候选snp位点数据中与snp位点关联的第一字符串；转换生成模块，响应于所述第一字符串转换生成第二字符，所述第二字符表征所述snp位点对应的基因型。
4、第三方面，实施例公开了一种电子设备。该电子设备包括：处理器；以及存储器，在所述存储器中存储有计算机程序指令，所述计算机程序指令在被所述处理器运行时使得所述处理器执行第一方面所述的筛选方法。
5、第四方面，实施例公开了一种计算机可读存储介质。所述计算机可读存储介质上存储有计算机程序指令，当所述计算机程序指令被计算装置执行时，可操作来执行第一方面所述的筛选方法。
6、实施例提供的玉米snp位点的筛选方法、装置、电子设备及介质，通过收集的玉米材料构成第一材料集，对这些材料集中的已知公开了snp位点的数据进行有效整理，能够显著提高筛选效率。其中，该整理方法是通过对与snp位点关联的第一字符串进行识别和转换生成第二字符实现的，并且通过第二字符表征每一snp位点对应的基因型，如此为后期将筛选得到snp位点进行组合和制作snp芯片提供了准确而高效的信息基础。
1.玉米snp位点的筛选方法，其包括：
2.根据权利要求1所述的筛选方法，所述转换生成包括：
3.根据权利要求2所述的筛选方法，所述转换生成还包括：
4.根据权利要求2所述的筛选方法，所述转换生成还包括：
5.根据权利要求2所述的筛选方法，所述转换生成还包括：
6.根据权利要求1所述的筛选方法，其中，“获得第一材料集的候选snp位点数据”的方法包括：
7.根据权利要求1～6任一所述的筛选方法，其中，所述关联分析包括：
8.一种玉米snp位点的筛选装置，包括：
9.一种电子设备，包括：
10.一种计算机可读存储介质，所述计算机可读存储介质上存储有计算机程序指令，当所述计算机程序指令被计算装置执行时，可操作来执行如权利要求1-7中任一项所述的筛选方法。
